一种新的免疫信息学辅助工具（EpiCC）评估PCV2疫苗免疫覆盖率

引 闻

PCV2是一种比较小的环状单链DNA流感病毒。它是所有DNA流感病毒中会突变率最高的，与RNA流感病毒相当。由于突变和重组的必要，PCV2遗传物质大幅度生物，并且这种生物仍在欧洲和全世界其他地方进行时。商用PCV2疫苗接种现在包括了对与感染相关的临床疾病的必需操纵，但是过往，田间流感流感病毒和疫苗接种流感病毒二者之间的遗传差距现在扩大。

除了用到PCR、组织学和免疫反应组化等传统PCV2临床除此以外，现在还有基于人工智能和免疫反应信息学模型的新作法，这些作法有助于提升养猪业中会PCV2的操纵1。

本科学研究的旨在是确定疫苗接种株与象征性法国目前流行起来株的PCV2野流感流感病毒大样本二者之间的T细胞表位差异性评价。

涂层和作法

评估了三种市售PCV2疫苗接种（两种疫苗接种基于PCV2a遗传基因，一种疫苗接种有数PCV2a和PCV2b两种遗传基因）的T细胞受体可辨识表位与来自法国农场的大样本PCV2流感流感病毒表位二者之间的差异性。用到了表位含量比较（EpiCC）算法（EpiVax Inc, Providence, Rhode Island, USA）。

用到PigMatrix表位预测基本功能统计分析了PCV2野流感流感病毒和疫苗接种流感流感病毒糖蛋白的核酸序列，以便在ORF2编码的蛋白质中会辨识或许与I类和II类猪主要组织相容性复合体猪红细胞蛋白质(SLA)相容的表位。用到PigMatrix和EpiCC算法，将扩展到科学研究的疫苗接种流感流感病毒的T淋巴细胞表位含量与除此以外的PCV2流感流感病毒进行时了比较。

娆 叶

2018 年至 2021 年间，从法国 14 个省的71 家农场收集了75株PCV2 流感流感病毒。这些野流感流感病毒主要是PCV2d（占总数目的60%，45株），其次是 PCV2b（32%，24 株）和PCV2a（仅有8%，6 株）（绘出1）。

绘出1 法国流行起来的PCV2遗传基因分布

以火控系统绘出的基本概念份文件EpiCC 评价娆叶（绘出 2），每个表面积象征性一种野流感流感病毒。按遗传基因将这些流感流感病毒进行时分组，用绿色点表示每组流感流感病毒的PCV2a-PCV2b 疫苗接种（CircoMax® Myco）EpiCC评价，与疫苗接种A（黑点）和疫苗接种B（绿点）的EpiCC评价远比（这两种疫苗接种都仅有基于PCV2a遗传基因）。formula_的野流感流感病毒和疫苗接种株二者之间的共同表位得越多，EpiCC全队得越少，象征性疫苗接种株的点得越接近外圈。而得越靠近外圈，反之亦然疫苗接种包括的预计免疫反应覆盖率就得越好。通过比较这 EpiCC评价，可以确定，对于这些野流感流感病毒，与疫苗接种A远比，CircoMax® Myco可包括高达35%的额外免疫反应覆盖率，与疫苗接种B远比，可包括高达30%的额外免疫反应覆盖率。

绘出2 以火控系统绘出基本概念展示的75种法国PCV2流感流感病毒的 EpiCC评价娆叶（红色：基于PCV2a遗传基因的疫苗接种 A；紫色：基于PCV2a遗传基因的疫苗接种B；绿色：有数PCV2a和PCV2b两种遗传基因的CircoMax® Myco)

娆 论

对于所统计分析的PCV2野流感流感病毒，除芽孢价外还包含PCV2的两种遗传基因的三价疫苗接种的免疫反应覆盖率略低于只含PCV2a遗传基因的单价疫苗接种。

参考文献：

1 Angulo J. et al. 2021. Use of a novel immunoinformatic tool (EpiCC) to determine T cell epitope coverage from different PCV2 vaccines against field European strains. ESPHM 2021

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